政府会计制度下，事业单位发生现金短缺账务处理参考：

借：待处理财产损溢

贷：库存现金

借：其他应收款（应由责任人赔偿的部分）

资产处置费用（属于无法查明原因的部分）

贷：库存现金

参考文件：《关于印发《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》的通知》（财会[2017]25号）附件1902待处理财产损溢。