专项应付款科目核算企业取得政府作为企业所有者投入的具有专项或特定用途的款项，具体的账务处理您参考：

1、收到资本性拨款:

借:银行存款

贷：专项应付款

2、将专项或特定用途的拨款用于工程项目：

借：在建工程等

贷：银行存款、应付职工薪酬等

3、工程项目完工形成长期资产的部分：

借：固定资产

贷：在建工程

借：专项应付款

贷：资本公积—其他资本公积

4、未形成长期资产需要核销的部分：

借：专项应付款

贷：在建工程等

5、拨款结余需要返还的：

借：专项应付款

贷：银行存款

6、项目完工拨款结余不需上交原拨款部门的款项部分：

借：专项应付款

贷：资本公积—其他资本公积

参考文件：《企业会计准则应用指南—会计科目和主要账务处理》—2711“专项应付款”。