办理增值税期末留抵退税后，在申报增值税时，将税务机关核准的允许退还的留抵税额填写到增值税的下列报表中：

1、《增值税及附加税费申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）第22栏“上期留抵税额退税”做进项税额转出；

2、《增值税及附加税费申报表附列资料（五）》（附加税费情况表）第8栏“当期新增可用于扣除的留抵退税额”，同时体现到本表第3列“留抵退税本期扣除额”参与附加税费的计算。

参考文件：《国家税务总局关于办理增值税期末留抵退税有关征管事项的公告》（国家税务总局公告2025年第20号）第十二条。