按照现行政策规定适用差额征税办法缴纳增值税，且不得全额开具增值税发票的（财政部、税务总局另有规定的除外），可以使用税控新系统的差额征税开票功能。但是并没有政策明确不得全额开具发票的情形，所以适用差额征税的纳税人一般都是按照全额开具发票，然后通过填写报表实现差额纳税。

温馨提示：实务中各地税局对开票的要求是不同的，具体以当地税局要求为准。

参考文件：《国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告》（国家税务总局公告2016年第23号）第四条（二）款。