企业发行股票支付的佣金和手续费原则上需冲减资本公积、留存收益，建议按照差错调账处理。实务中若企业已计入了管理费用，金额不是很大，也不想调账，可以参考以下原则填写汇算清缴表：
1、若属于小微企业，需填写A104000表“管理费用”列第6行“佣金和手续费”行次；若属于非小微企业，可以免于填报A104000表，直接在主表手工填写管理费用行次即可。
2、企业为发行权益性证券支付给有关证券承销机构的手续费及佣金不得在税前扣除，所以虽然您计入了管理费用也不能税前扣除，就这笔业务还需要在A105000表第23行“佣金和手续费支出”进行调整：
第1列“账载金额”填报会计上计入当期损益的佣金和手续费金额；
第2列“税收金额”填报0；
第3列“调增金额”填报第1列金额。
小贴士：涉及其他佣金和手续费支出金额的，应当合并填写。
参考文件：《企业会计准则第20号—企业合并》第八条；（财税[2009]29号）第二条。