排污许可证，是指排污单位向环境保护行政主管部门提出申请后，环境保护行政主管部门经审查发放的允许排污单位排放一定数量污染物的凭证。排污单位应当依法持有排污许可证，并按照排污许可证的规定排放污染物。应当取得排污许可证而未取得的，不得排放污染物。

而环境保护税主要是针对污染破坏环境的特定行为征税，是对直接向环境排放应税污染物（大气污染物、水污染物、固体废物和噪声）征收的一种税。

所以，是否需要缴纳环保税和企业是否有排污许可证没有必然的关系。一般来讲，纳入排污许可管理，并直接向环境排放应税污染物的单位，就需要缴纳环境保护税。如果是向污水集中处理、生活垃圾集中处理场所排放应税污染物的，在符合环境保护标准的设施、场所贮存或者处置固体废物的，以及对畜禽养殖废弃物进行综合利用和无害化处理的，都不属于直接向环境排放污染物，则不需要缴纳环境保护税。

注：排污许可证和环保税是相辅相成的，排污许可管理和环境税征管都是基于排污许可证的执行来实现的。