事业单位会计制度和民间非营利组织会计制度的主要区别您参考：
1、适用范围和主体不同
事业制度：主要适用于事业单位的资金为国家全额拨款的情况，它仅适用于国有事业单位。
民间制度：适用于在中国境内依法设立的符合该制度规定特征的民间非营利组织，包括依照国家法律、行政法规登记的社会团体、基金会、民办非企业单位和寺院、教堂等。
注：民间非营利组织应同时具备以下特征： ① 该组织不以营利为宗旨和目的；② 资源提供者向该组织投入资源不取得经济回报；③资源提供者不享有该组织的所有权。
2、会计计量基础不同
事业制度：会计核算一般采用收付实现制，但经营性收支业务可采用权责发生制。
民间制度：会计核算应当以权责发生制为基础。
3、会计要素不同
事业制度：设置了资产、负债、净资产、收入、支出5个会计要素。
民间制度：设置了资产、负债、净资产、收入、费用5个会计要素。