自然人转让股权申报个税有以下两种情况

情况一、自然人将股权转让给企业，且被投资单位与该企业是同一个税局，可以受让企业代扣代缴，也可以自然人自行申报。

情况二、其他情况均由转让方自然人自行申报。

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[link]股权转让所得的申报流程[/link]——受让企业申报代扣代缴股权转让个税 

[link]个人如何办理股权转让所得税款申报缴纳[/link]——自然人（转让方）自行申报股权转让个税