不征税的通行费发票不可以进行抵扣。

小贴士：不征税的通行费电子发票，左上角没有“通行费”字样，“税率”栏显示“不征税”、“税额”不显示金额

参考文件：《交通运输部 财政部 国家税务总局 国家档案局关于收费公路通行费电子票据开具汇总等有关事项的公告》（交通运输部 财政部 国家税务总局 国家档案局公告2020年第24号）第二条