通过第三方订的机票，若取得的是注明员工身份信息的电子发票（普通发票），且是“运输服务”的发票，是可以按规定进项抵扣的；若未注明旅客身份信息或不是运输服务发票，则电子普票不可以进项抵扣。

参考依据：新华社：列明旅客身份信息的增值税电子普票可以抵税。