自然人转让商标所有权属于特许权使用费所得，应以所得以收入减除费用后的余额为收入额，按百分之二十的比例预扣率计算税额。并在办理年度综合所得汇算清缴时，应当依法计算劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得的收入额，并入年度综合所得计算应纳税款，税款多退少补。