员工在其他单位的薪资不可以合并在本单位申报个税，因个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人，需要由支付所得的单位按规定代扣代缴。
参考文件：《中华人民共和国个人所得税法》第九条。

员工在其他单位的薪资不可以合并在本单位申报个税的。

个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。需要由支付所得的单位按规定代扣代缴。可参考《中华人民共和国个人所得税法》第九条