我们可以大致把应纳税所得额的计算过程分为三大步骤：

查账征收的经营所得，和企业所得税的计算方式类似，也是采用一种倒算的方法，先把被投资单位的利润总额计算出来，然后再进行纳税调增、调减。计算出纳税调整后所得，减去弥补以前年度亏损后，乘以合伙人的分配比例，相当于第一大步骤是计算出了投资者从被投资单位分得的所得。

第二大步骤是用上述所得减去投资人减除费用6万元，专项扣除、专项附加扣除、其他扣除，允许扣除的捐赠后，就是投资人经营所得的应纳税所得额。

第三大步骤就是用应纳税所得额，计算出应纳税额，然后减去减免税额、已缴税额，算出应补退税额

小贴士：同时取得综合所得和经营所得的纳税人，可在综合所得或者经营所得中申报减除费用六万元、专项扣除、专项附加扣除以及依法确定的其他扣除，但不得重复申报减除。——《个人所得税综合所得汇算清缴管理办法》（国家税务总局令第57号）第十条