一个自然人设立三个个体工商户，一个核定征收两个查账征收，需要按规定合并申报经营所得C表时，核定征收是否可以扣除投资者减除费用和专项附加扣除，区分以下情况：
1、只取得了多处经营所得，没有综合所得，则年终汇算清缴时，可以选择在某个查账征收的个体户中扣除投资者减除费用6万元（只能在一处扣）、专项扣除、专项附加扣除等。合并申报C表时，若涉及调整的再进行调整，如：投资者减除费用没有扣完的，可以通过C表进行纳税调减。
2、既取得了多处经营所得，又取得综合所得的，则可在综合所得或经营所得中申报减除费用6万元、专项扣除、专项附加扣除以及依法确定的其他扣除，但不得重复申报减除；选择在经营所得中扣除的，按第1点。