是否可以在申报个税时扣除，实务中有以下两种观点，具体请以当地税局的要求为准：

观点一、个人全额承担的社保，只有个人部分能够在计算个人所得税时扣除，个人承担的应该由公司承担的部分，不能在计算个人所得税时扣除。理由是个人承担公司应交付部分，不属于个人按照规定的比例交纳，故而不能在个人所得税前扣除。

观点二、个人以单位名义缴纳的社保，应当免征个人所得税。个人负担的单位社保部分可以理解为并入员工工资薪金了，可以和单位承担这部分社保采取一样的处理方式，并入工资薪金时享受免税。如税局允许按照此口径执行，理解在填写个税申报表时，收入额是不包含“单位”按比例缴纳的社保金额的，也就不涉及扣除或申报减免。

参考文件：《个人所得税法》第六条；《财政部，国家税务总局关于基本养老保险费，基本医疗保险费，失业保险费，住房公积金有关个人所得税政策的通知》（财税[2006]10号）。