☆商贸企业增值税税负率低不代表一定有问题，但如果和同区同行税负率差异较大，容易引起税局关注。您可以参考以下方面结合实际业务做好分析应对：
1、关注企业登记行业代码是否和实际经营相匹配，比如是批发还是零售，这两个行业税负率是有差异的，若登记行业跟实际经营不匹配，建议及时做变更登记。
2、关注是否存在已经发生增值税纳税义务但未申报的销售收入。比如：未开具发票的销售收入，也需要申报纳税。
3、关注是否存在不允许抵扣的进项税额，未做进项转出，比如用于免税项目、简易征收项目、集体福利，非正常损失的进项，需要做进项税额转出。
4、发票已取消认证期限，建议结合税负率情况，合理安排认证抵扣的进项税额，使税负趋于稳定。
5、如果销项和进项申报没有问题，可以分析下税负率低的原因，留存相关资料备查，比如：
①是否存在多税率业务混合经营的情况，若企业同时还存在低税率的服务收入，会一定程度拉低整体税负率，则可能导致和纯商贸企业相比税负率偏低。
②是否属于初创期企业、或者有大量的存货购进、购进大额固定资产等情况，导致进项多，销项少，从而拉低了税负率。
③是否有享受当地特殊的优惠政策，若有予以解释说明。