小规模开具的3%农产品专票，您单位在待处理农产品发票模块处理确认后，就可以正常勾选抵扣了，但勾选2026年之前开具的发票时，有些3%农产品发票存在农产品和非农产品混开的情况，勾选时进项税额自动计算，并不一定就是发票上的金额合计*9%（因为有些专票中开具的部分货物不属于农产品，或编码开具不规范，未按农产品开具），您可以核对一下税额。