不能按9%进项抵扣的农产品发票如下：

1、小规模开具的1%农产品专票，只能按1%抵扣；

2、流通或批发零售环节享受免税，开具的农产品免税发票（含数电票）不能进项抵扣；

3、左上角没有“自产农产品销售”标签的农产品数电免税发票，不能进项抵扣；

4、所有带税率的农产品普通发票（含数电），不能进项抵扣。