航空运输电子客票行程单数电票上没有填写企业信息属于不合规的凭证，不能在企业所得税税前扣除。

参考文件：《国家税务总局关于国内旅客运输服务进项税抵扣等增值税征管问题的公告》（国家税务总局公告2019年第31号）第一条。