不同公司名下的店铺，不能用其中一家公司的名义申报全部店铺的增值税，需要不同的公司分别申报各自店铺的收入，增值税目前是以税号管理的，一个税号作为一个纳税主体（汇总纳税除外），签订协议约定也不能免除其他公司的增值税申报义务。

小贴士：如果是同一公司名下的，多个店铺或多个平台内的店铺需要合并申报增值税。