根据财政部 税务总局公告2026年第12号规定，航空运输销售代理企业提供境外航段机票代理服务，以取得的全部含税价款，扣除向购买方收取并支付给其他单位或者个人的境外航段机票结算款和相关费用后的余额计算销售额。 航空运输销售代理企业就取得的全部含税价款，向购买方开具普通发票。

具体开具发票时：

支付给其他单位或个人的境外航段机票净结算款和相关费用，按不征税（编码619）开具发票（含支付给境内和境外的款项），扣除后的余额按其他经纪代理服务（编码3040802990000000000）开具发票，这两部分开到一张发票上，一般纳税人适用税率为6%，小规模纳税人征收率为3%（2027年12月31日前减按1%）。