纳税人跨区域排放应税污染物的，应当向应税污染物排放地的税务机关申报缴纳环境保护税。应税污染物排放地是指应税大气污染物、水污染物排放口所在地，应税固体废物产生地，应税噪声产生地。

注：税务机关对税收征收管辖有争议的，由争议各方按照有利于征收管理的原则协商解决；不能协商一致的，报请共同的上级税务机关决定。

政策依据：《中华人民共和国环境保护税法》（中华人民共和国主席令第六十一号）第十七条、《中华人民共和国环境保护税法实施条例》（中华人民共和国国务院令第693号）第十七、十八条。