应税水污染物的计税依据按照污染当量数从大到小排序，对第一类水污染物按照前五项征收环境保护税，对其他类水污染物按照前三项征收环境保护税。

应纳环境保护税税额=污染当量数X具体适用税额

水污染物的污染当量数=污染物排放量÷污染物当量值

参考文件：《中华人民共和国环境保护税法》（中华人民共和国主席令第六十一号）第八、九、十一条。