房地产企业销售车库（地下室、储藏室）的土地增值税问题可以参考以下情况处理：
①房地产开发企业与购房者签订车库、地下室转让合同的，其收入需要缴纳土地增值税，其成本费用允许按照对应配比原则在土地增值税清算中扣除。
②对于赠送车库、地下室的情形，按销售房地产的金额一并核算，收入不再区分类型，其成本费用归集到销售的房地产类型进行扣除。
小贴士：房地产开发项目中同时包含住宅、商铺、车库等不同类型产品的，应划分为普通住宅、非普通住宅、其他(商铺、车库等)三类分别计算增值额。
参考依据：《河北省地方税务局关于对地方税有关业务问题的解答》第三条。

房地产企业销售车库（地下室、储藏室）的土地增值税问题可以参考以下处理：
①能够办理权属登记手续的车库(地下室、储藏室等)单独转让时，应按“其他类型房地产”确认收入并计算成本费用。
②不能办理权属登记手续的车库(地下室、储藏室等)，区分以下情况：
1.建成后产权属于全体业主所有的，其成本、费用可以扣除;
2.建成后无偿移交给政府、公用事业单位用于非营利性社会公共事业的，其成本、费用可以扣除;
3.建成后有偿转让的，应计算收入，并准予扣除成本、费用。
小贴士：关于无产权车位分摊土地成本问题，土地成本仅在可售面积中分摊，无产权的地下车位不分摊土地成本。
参考文件：《新疆维吾尔自治区地方税务局关于明确土地增值税相关问题的公告》（新疆维吾尔自治区地方税务局公告2016年第6号）第四条。