小规模纳税人期间未执行完的合同，登记为一般纳税人后，开票主要看纳税义务发生时间。若纳税义务发生时间在小规模期间，按当时适用的3%或5%征收率开具；若纳税义务发生时间在一般纳税人期间，需要按照一般纳税人期间对应的税率开具。