先注销分公司，再注销总公司。因为分公司不具有法人资格，分公司办理注销时需要总公司出具相关的证明等资料（例如总公司出具的注明分公司注销原因的注销决议、指定代表或者共同委托代理人的证明等），所以注销时需要先注销分公司。总公司注销时也要核实其规模及其全部的经营情况等。