个人承担的社保部分一般会先在发工资时扣除，再支付给社保部门。

具体的账务处理您参考：

1、发工资时：

借：应付职工薪酬—工资

贷：其他应付款—养老、医疗等（个人承担部分）

应交税费—应交个人所得税

银行存款

2、单位缴纳社保时：

借：应付职工薪酬—养老、医疗等保险（单位承担部分）

其他应付款—养老、医疗等（个人承担部分）

贷：银行存款