综合所得采用累计预扣法计税：

本期应预扣预缴税额=（累计预扣预缴应纳税所得额×税率-速算扣除数）-已预扣预缴税额

累计预扣预缴应纳税所得额=累计收入-累计免税收入-累计基本减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除-累计依法确定的其他扣除

这种情况对于员工个人来说，在专项附加扣除采集前可能会多预缴税款，但在采集后每次申报时会累计扣除前几个月的总和，如果税款为负值的，暂不退税，一直往后留抵，在次年3-6月进行个人年度汇算清缴申报时多退少补。

参考文件：个人所得税专项附加扣除200问第一百零六条。