营利性医疗机构的税收优惠有：

1、符合条件的医疗机构提供的医疗服务免征增值税。

注：对于医疗机构和医疗服务的具体规定可参考：财税[2016]36号附件三 第一条第七项。

2、直接用于改善医疗卫生条件的，自其取得执业登记之日起，3年内给予下列优惠：

对其自产自用的制剂免征增值税；对营利性医疗机构自用的房产、土地、车船免征房产税、城镇土地使用税和车船使用税。3年免税期满后恢复征税。

注：对营利性医疗机构的药房分离为独立的药品零售企业，应按法规征收各项税收。 

参考依据:《财政部国家税务总局关于医疗卫生机构有关税收政策的通知》（财税2000 42号）第二条。