有机肥放弃免税后，按销售有机肥开具发票，一般纳税人税率为13%，小规模纳税人征收率为3%（2027年12月31日前减按1%）。

注：因有机肥不属于《财政部 税务总局关于增值税征税具体范围有关事项的公告》（财政部 税务总局公告2026年第9号）规定的低税率产品的范围，所以按一般货物税率。