分支机构亏损，需要结合总分机构汇总后的应纳税所得额情况分析，该分支机构是否有税额，不考虑特殊因素，常见情形您参考：
1、企税季报时，若汇总后依然是亏损，分配表中该分支机构没有税额，税额体现为0；若汇总后是盈利，按照分配比例计算该分支机构的应纳税额，分配表中该分支机构是有税额的。
2、企税汇缴时，若汇总后依然是亏损，按照分配比例计算该分支机构的应退税额，税额体现为负数；若汇总后是盈利，按照分配比例计算该分支机构的应纳税额，分配表中该分支机构是有税额的。