企业购进药品取得3%税率发票，再销售时的增值税税率区分以下情况：

1、企业本身是小规模纳税人，再销售时增值税税率是3%（2027年12月31日前减按1%）；

2、企业本身是一般纳税人，如购进的是可以享受简易计税的罕见药品（财税[2019]24号）、抗癌药品（财税[2018]47号），再销售时增值税税率依然是13%，如不属于简易计税范围，很有可能上游企业额是小规模纳税人，那么企业再销售时，增值税税率是13%。