1.土地增值税以国家有关部门审批的房地产开发项目为单位进行清算；

2.对于分期开发的项目,一般以城市建设规划部门颁发的《建设工程规划许可证》所审批确认的分期项目为清算单位。

政策依据：

《浙江省地方税务局关于土地增值税若干政策问题的公告》（浙江省地方税务局公告2014年第16号）一、土地增值税清算单位的确定。

以向主管税务机关申报备案的《建设工程规划许可证》所载的建设项目名称为单位进行土地增值税的清算。

政策依据：

《国家税务总局福建省税务局关于土地增值税若干政策问题的公告》（国家税务总局福建省税务局公告2018年第21号）　三、关于土地增值税清算单位问题。

1、土地增值税以国家有关部门审批、备案的项目为单位进行清算；

2、对于分期开发的项目，以政府建设主管部门颁发的《建筑工程施工许可证》作为分期标准，以分期项目为单位清算；

3、2011年1月1日后采取分期方式开发、销售的房地产项目，可按政府规划主管部门颁发的《建设工程规划许可证》作为分期标准，以分期项目为单位进行清算。

政策依据：《厦门市土地增值税清算管理办法》（厦门市地方税务局公告2015年第3号）第二十五条。

土地增值税以国家有关部门审批的房地产开发项目为单位进行清算，对于分期开发的项目，以分期项目为单位清算。

开发项目中同时包含普通住宅和非普通住宅的，应分别计算增值额。

具体您可以参考《关于房地产开发企业土地增值税清算管理有关问题的通知》（国税发[2006]187号）第一条规定。