公司注销，在处置和分配存货等资产时需要按销售或视同销售缴纳增值税，此时可以按规定抵扣留抵税额，当应纳税额大于留抵税额时需要缴纳增值税；当应纳税额小于留抵税额，未抵减完的部分，增值税报表上不用做进项税额转出，也不予退税。

参考文件：《企业破产、倒闭、解散、停业后增值税留抵税额处理问题》（国税函【1998】429号）。