企业通过差额征税功能开具的发票，需要填写备注栏的。开票时需要录入含税销售额和扣除额，系统自动计算税额和不含税金额，备注栏会自动打印“差额征税”字样。

参考文件：《 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告》（国家税务总局公告2016年第23号）第四条（二）款。