综合所得应纳税所得额=（工资薪金所得+劳务报酬所得+稿酬所得+特许权使用费所得）-减除费用六万元-专项扣除-专项附加扣除-依法确定的其他扣除后的余额

其中：

劳务报酬所得=收入*（1-20%）

特许权使用费所得=收入*（1-20%）

稿酬所得=收入*（1-20%）*70%

然后根据应纳税所得额适用综合所得年度税率表计算应纳所得税额：

应纳所得税额=应纳税所得额*适用税率-速算扣除数

应补退税额=应纳所得税额-已预缴所得税额

举例：某人在2019年一整年内，工资薪金所得150000元，个人负担三险一金共计20000元，可以扣除的专项附加扣除12000元，另外取得兼职收入80000元，稿费收入3000元，已预缴的个人所得税22188元，请计算本年度的应补退税额。

综合所得应纳税所得额=150000+80000*0.8+3000*0.8*0.7-60000-12000-20000=123680（元）

查阅税率表可得：

应纳税额=123680*0.1-2520=9848（元）

应补退税额=9848-22188=-12340（元）

故应退税额为12340元。