总分公司之间正常的经济业务往来，是需要按非关联企业之间业务处理方式正常开具发票结算的。所以，如果总分公司之间发生了实际的业务往来，属于增值税应税范围的，正常开具发票缴纳税款即可，可以留存相关合同、收付款回单等资料备查。