保险机构作为车船税扣缴义务人，在代收车船税并开具增值税发票时：

1、如使用的原税控开票系统开票，应在增值税发票备注栏中注明代收车船税税款信息。具体包括：保险单号、税款所属期（详细至月）、代收车船税金额、滞纳金金额、金额合计等。

2、如开具的是数电票，应选择特定业务“代收车船税”开具，开具时直接填写保险单号、税款所属期（详细至月）、代收车船税金额、滞纳金金额、金额合计等信息（带*号的必填），开具后备注栏自动显示。保险机构如无此项特定业务开票功能，需要联系主管税务机关做归类。

温馨提示：该发票可以作为缴纳车船税的凭证。

政策依据：国家税务总局公告2016年第51号 国家税务总局关于保险机构代收车船税开具增值税发票问题的公告。​