主管税务机关向银行提取信息时比对出银行账户设置数大于纳税人向税务机关提供数，可能是公司未将开立的公司银行账户全部在主管税务机关备案，也可能是银行操作过错导致出现差异，建议查明原由尽快联系主管税务机关处理。

注意：银行账户设置数大于纳税人向税务机关提供数会影响到企业的纳税信用评级。

政策依据：《中华人民共和国税收征收管理法实施细则（2016年修订）》 第十七条　从事生产、经营的纳税人应当自开立基本存款账户或者其他存款账户之日起15日内，向主管税务机关书面报告其全部账号；发生变化的，应当自变化之日起15日内，向主管税务机关书面报告。