转让旧房发生的评估费用，在土地增值税扣除时是否含税需要分情况：

1、如果企业是一般纳税人，取得的评估费用正常认证抵扣了，那在土地增值税扣除时该评估费是不含增值税的；如果取得的增值税普通发票，或取得了扣税凭证不符合规定或符合规定但该纳税人主动放弃抵扣的，则按含增值税的金额扣除；

2、如果企业是小规模纳税人，该评估费就是含增值税的。