存货报废、毁损或变质损失，为其计税成本扣除残值及责任人赔偿后的余额，应依据以下证据材料确认：
1、存货计税成本的确定依据；
2、企业内部关于存货报废、毁损、变质、残值情况说明及核销资料；
3、涉及责任人赔偿的，应当有赔偿情况说明；
4、该项损失数额较大的（指占企业该类资产计税成本10%以上，或减少当年应纳税所得、增加亏损10%以上），应自行出具的有法定代表人、主要负责人和财务负责人签章证实有关损失的书面申明。
参考文件：（国家税务总局公告2011年第25号）第二十七条；（国家税务总局公告2018年第65号）附件第三条。