企业开具的发票已申报缴纳增值税，现被税局认定为虚开发票，不需要按照其虚开金额补缴增值税。

需要注意的是，虚开增值税专用发票的行为，税务机关对纳税人会按《中华人民共和国税收征收管理办法》及《中华人民共和国发票管理办法》的有关规定给予处罚。

参考文件：《国家税务总局关于纳税人虚开增值税专用发票征补税款问题的公告》（国家税务总局公告2012年第33号）。