自然人出租不动产需要申请代开增值税发票，目前有以下几种，您可以参考：

1、在手机电子税务局App中或者电子税务局网页版，自然人实名登录后，点击代开增值税发票申请代开；

2、在微信小程序@深税的发票模块下申请代开；

4、自然人出租不动产可以向相应街道办（租赁办）申请代开增值税普通发票；需要增值税专用发票的，须到办税服务厅凭缴款凭证申请换开或在申报缴款后申请代开（具体办理以所属街道为准）。

参考文件：深圳市国家税务局 深圳市地方税务局通告2016年第7号第三条