房地产企业发生的非正常损失对应的增值税进项税额，不允许在计算土地增值税时扣除。
小贴士：土地增值税扣除项目涉及的增值税进项税额，允许在销项税额中计算抵扣的，不计入扣除项目；不允许在销项税额中计算抵扣的（如，用于免税项目、集体福利等），可以计入扣除项目。
参考文件：《财政部 国家税务总局关于营改增后契税 房产税 土地增值税 个人所得税计税依据问题的通知》（财税[2016]43号）第三条；国税总局2016年4月25日“营改增”视频会议解答。