公司代理销售商家的产品，赚取差价，需要根据实际发生的业务和签订的合同判断：
1.签订的合同若属于代理合同，只收取代理费，公司开具销售产品的发票给客户，商家收到代销清单时再给公司开具销售发票，同时由公司向商家开具代理服务的发票。
2.签订的合同若属于销售合同，商家直接销售给公司，由公司对外销售，则由公司开具销售产品的发票给客户，商家开具销售产品的发票给公司。