跨地区提供建筑服务，预缴企业所得税时，不可以扣除分包款，应按项目不含税收入的0.2%进行预缴。

参考文件：《国家税务总局关于跨地区经营建筑企业所得税征收管理问题的通知》（国税函[2010]156号）第三条。

跨地区提供建筑服务，预缴企业所得税时，一般是可以扣除分包款的。实务中各地执行可能存在差异，具体以当地税局要求为准哦。

参考文件：《关于省内跨地区经营建筑企业所得税征收管理有关问题的公告》（福建省税务局公告[2018]36号）。