自收自支、自负盈亏的事业单位用地应征收城镇土地使用税。由国家财政部门拨付事业经费的单位自用的土地，免征城镇土地使用税。

参考文件：《关于土地使用税若干具体问题的解释和暂行规定》（国税地字[1988]第015号）九、关于由国家财政部门拨付事业经费的单位的解释：由国家财政部门拨付事业经费的单位，是拽由国家财政部门拨付经费、实行全额预算管理或差额预算管理的事业单位。不包括实行自收自支、自负盈亏的事业单位。